На борту човника перебував полковник Володимир Комаров. Та політ закінчився трагедією - під час приземлення апарату, космонавт загинув.
У планах науковців було не лише випробування корабля в пілотованому режимі. Вони мали намір зробити першу в історії космонавтики стиковку пілотованих кораблів. Одразу після "Союзу-1" до вильоту готувався ще один апарат - "Союз-2" із трьома космонавтами на борту.