Гонгадзе начал публиковать материалы, касающиеся тогдашнего президента Кучмы, начиная с апреля 2000-го года. В своих статьях Георгий разоблачал верхушку власти в связях с организованной преступностью и обнародовал многочисленные коррупционные схемы, в которых был задействован президент.
Следить за журналистом начали летом 2000-ного года. Гонгадзе повсюду сопровождал автомобиль "Жигули", из которого почти неприкрыто вели видео - и фотосъемку. Несмотря на многочисленные обращения в прокуратуру правоохранители отказались расследовать дело и защитить журналиста.
16 сентября около 11 часов вечера Гонгадзе вышел с работы и пропал. 2 ноября в лесу возле Таращи был найден обезглавленный труп. Жена и друзья узнали в нем Георгия. А 28 ноября, через два месяца после исчезновения Гонгадзе, Александр Мороз обнародовал так называемые пленки Мельниченко.
Из записей, тайно сделанных майором СБУ в кабинете Леонида Кучмы, общественность узнала, что президент требовал от своего ближайшего окружения избавиться от надоедливого журналиста. Подозрение в организации убийства сразу же упала на тогдашнего министра внутренних дел Юрия Кравченко, главу СБУ Леонида Деркача и руководителя администрации президента Владимира Литвина.
Расследование убийства Гонгадзе продолжалось долгие 13 лет. В 2009-м был задержан один из исполнителей убийства – генерал Пукач. Его в 2013-м признали виновным и приговорили к пожизненному заключению. Во время объявления приговора Пукач заявил – он убил Гонгадзе по заказу Кучмы, Литвина и Кравченко. Последний покончил жизнь самоубийством при загадочных обстоятельствах в 2005-м году, Кучма и Литвин до сих пор находятся на свободе. Уголовные дела против них закрыты.