Досудове слідство встановило, що Данилишин "будучи представником влади та службовою особою,...умисно, в інтересах третіх осіб, використав владу та службове становище всупереч інтересам служби, що спричинило тяжкі наслідки".

Данилишина звинувачують у безпідставних державних закупівлях, які призвели до багатомільйонних збитків для держави.

Суд дозволив обшук помешкання Данилишина, припускаючи, що можуть знаходитись "речі й цінності, здобуті злочинним шляхом, інші предмети і документи, які мають значення для встановлення істини у справі та забезпечення можливого в майбутньому цивільного позову".