Первая книга, "Апрельский снег", вышла в 1962 году. Затем более десяти поэтических сборников ("Мосты облаков", "Солнцестояние", "Те же слова" и др.).. Широкую известность получили его "Кукутисовы баллады", выдержавшие несколько изданий. Выпустил поэт несколько книг эссе, пьес для кукольного театра. Опубликовал несколько сот эссе, поэтических переводов.
Марцелиюс Мартинайтис - лауреат Национальной премии по литературе и искусству.
Принадлежал Мартинайтис к руководству Саюдиса, был депутатом, числился во всевозможных советах и обществах. Председательствовал в совете Литовского национального радио и телевидения.