Події почалися за два дні до цього, коли група протестуючих виступила з вимогою звільнити 23 місцевих підприємця, на їхню думку, заарештованих незаконно. Пізніше озброєна група людей захопила військовий гарнізон і в'язницю.
13 травня 2005 року люди стали збиратися на центральну площу Бабура в надії на те, що влада почує їхні вимоги. Однак, в місто були введені війська — по мітингуючим відкрили вогонь з важкої артилерії.
Уряд Узбекистану назвав цифру у 187 осіб, яких було вбито. Свідки ж повідомляють про сотні загиблих. Влада не визнає, що втрати пов'язані з діями правоохоронних органів. Всю провину покаладають на ніби то ісламістських екстремістів.
Міжнародне співтовариство неодноразово закликало владу Узбекистану провести незалежне розслідування андіжанських подій, проте 10 років потому цього досі не сталося.
