Як наголошується в прес-релізі міністерства, на першому етапі планується провести передачу вишів, підпорядкованих міністерствам і відомствам, до сфери управління Міністерства освіти і науки, молоді та спорту. Другий етап передбачає укрупнення ВНЗ через їх об'єднання і створення університетів регіонального типу.
Міністерство заявляє про "необхідність централізації управління системою вищої освіти, яка повинна бути здійснена в умовах дефіциту бюджетних коштів на її утримання і передбачати подальше скорочення кількість центральних органів виконавчої влади, у сфері управління яких будуть перебувати вищі навчальні заклади різних рівнів акредитації".
Міністерство має намір привести мережу вищих навчальних закладів у відповідність з європейською практикою — до єдиного освітнього простору.