Массера входив до складу хунти, яка правила Аргентиною з 1976 по 1983 роках. В 1976 році він був одним із організаторів військового перевороту у державі і згодом увійшов до триумвірату, який здійснював керівництво державою.
В 1985 році Массеру та інших членів хунти засудили до довічного ув'язнення. Проте вже в 1990 році Массеру помилували і випустили на волю. В 1998 році у його справі знову почалося розслідування і колишнього диктатора знову взяли під варту. В 2005 році з огляду на важкий стан здоров'я Массери як покарання йому висунули домашній арешт.