Конгантієв - один з екс-керівників країни, оголошених чинною владою в розшук за звинуваченням у загибелі людей під час заворушень 7-8 квітня. Тоді міліція відкрила вогонь по багатотисячному натовпу протестувальників на головній площі Бішкека. На придушення безладів кинули спецназ і бронетехніку.

7 квітня Конгантієва опозиціонери жорстоко побили в Таласі, звідки й починалися заворушення в Киргизстані. З важкими травмами його доправили в Бішкек. Згодом про його долю були суперечливі дані. Деякі ЗМІ повідомляли, що він поїхав до Казахстану.