Протягом 2008 року і 9 місяців 2009 року в зоопарку продали за готівковий розрахунок фізичним особам-підприємцям: далекосхідного леопарда - за 500 грн., дикого кабана - 500 грн., верблюда - 298 грн., єнота-полоскуна - 38 грн ., павича - 1000 грн., 3 голови сірої української худоби - 3000 грн, 6 голів вовків вартістю по 100 грн кожен. У той же період цей же підприємець перепродав чорного лебедя за 4600 грн.
Внаслідок халатності працівників зоопарку тварини втікали. При цьому, винні особи не визначені і втрати не відшкодовують. Зоопарком укладалися нерівномірні угоди обміну. 2 фламінго Одеський зоопарк обміняв на 2 вовка, 2 ведмедя, 2 поні, 2 лами, 7 муфлонів і 2 осла.
Перший заступник начальника КРУ в Одеській області Василь Приймак повідомив, що в Одеському зоопарку вартість тварини при продажу, обміні і оренди встановлюється керівництвом зоопарку самостійно і суттєво відрізняється від ринкової.