На другу стадію розкопок виділили 110 тисяч євро. Пошуки поховання Герардіні ініціював професор Сільвано Вінчеті, який зараз обіймає посаду голови Національного комітету зі зміцнення історичної та культурної спадщини. Перші розкопки тривали з квітня по грудень 2011 року, після чого у дослідників закінчилися гроші.
Під час перших розкопок вчені виявили жіночий скелет. Однак дослідники потім встановили, що знайдені кістки на 200 років "старші" за Лізу Грерардіні. Вчені вважають, що Герардіні треба шукати на території колишнього монастиря Святої Урсули у Флоренції. Зокрема, такої думки дотримується історик Джузеппе Палланті, який в одній з книг обліку померлих знайшов запис, що вона похована саме там.
Ліза Герардіні була дружиною флорентійського купця Франческо дель Джокондо. До висновку, що саме вона позувала да Вінчі, прийшов знаменитий італійський вчений XVI століття Джорджо Вазарі, автор книги "Життєписи найбільш знаменитих живописців, скульпторів і зодчих". За іншими версіями, моделлю для живописця могла бути дочка міланського герцога Бьянко Сфорца, крім того, деякі вважають, що Леонардо зобразив самого себе.