Диктатор також отримав посади головнокомандуючого збройними силами, голови Ради революційного командування і генерального секретаря регіонального керівництва партії арабського соціалістичного відродження — БААС.
Першими кроками нового президента стали масові чистки партапарату та органів влади. Хуссейн почав репресії проти керівних партійців БААСу, міністрів і тих, хто допомогли йому прийти до влади.
За 24 роки при владі Хуссейн неодноразово вирішував міжнародні конфлікти. Масштабним з них стала війна Іраку проти Ірану, яка почалася 22 вересня 1980, і тривала протягом 8 років. У ході цієї війни відбулася так звана "Божевільна битва", в якій Ірак використовував хімічну зброю — іприт.
5 листопада 2006 Трибунал Іраку визнав Саддама винним у вбивстві 148 шиїтів і засудив до смертної кари через повішення. Після тривалих судових процесів 30 грудня 2006, колишнього президента Іраку Саддама Хуссейна стратили.