Причинами воєн та негараздів у країні були релігійні суперечності, які виникали між християнами (здебільшого мешканцями півдня) та мусульманами.
Першою країною, що визнала незалежність Південного Судану, став Ізраїль.
8 липня після тривалого конфлікту, перемир'я та референдуму, що відбувся в лютому цього року, Судан визнав незалежність Південного Судану. 9 липня країна проголосила себе незалежною.