Він кілька разів змінював свій стиль, адже його постійно перебудовували. Найбільше костел постраждав під час облоги Львова Богданом Хмельницьким у 1648 році. Саме тут, поруч з костелом, у ньому та біля нього, тривали найзапекліші бої.

Гордість костелу – орган. Він найбільший в Україні. На замовлення монахів його виготовила чеська фірма “Rieger – Kloss”. Інструмент має аж 60 регістрів. Хоча спершу було на 10 більше. Втім, під час реставрації, їх довелося забрати, аби не псували звуку.

Орган складається з 4,5 тисячі труб. Незвичайним і оригінальним в цьому інструменті було те, що 12 регістрів були розміщені окремо, в іншому кінці залу, у спеціальній шафі. Для гри на цій частині органа треба було відчинити вікна в кімнаті над вівтарем, бо зачинені вікна створювали ефект приглушення гучності.